В 2015 году герои Шон и Ребекка проникают в один из офисов "Абстерго индастриз", который находится в Лондоне, где устанавливают жучки. Там они находят информацию о том, что Абстерго просматривает жизнь британских убийц Джейкоба и Эви Фрай, надеясь найти Кусочек Эдема, спрятанный в Лондоне.
В центре истории прошлого-близнецы-убийцы Джейкоб и Эви Фрай. Они едут в Лондон, чтобы разместить там свои заказы и в то же время найти Кусочек Эдема.
Однако более захватывающим нововведением в механике Синдиката был гарпун. Он активно используется во время скрытного прохода - гарпун позволяет мгновенно менять положение и экономить время.
Еще одним важным аспектом игры является банда. Вы можете тратить деньги и ресурсы не только на себя, но и на своих союзников. Вкладывая деньги в развитие Грачей, вы поможете им саботировать Виселицу. Вне сюжета начинается кампания классического Assassin's Creed: башни, освобождение территорий и множество сторонних заданий.